Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF8

PABPC1L2A, Polyadenylate-binding protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PABPC1L2AQ5JQF8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PABPC1L2AQ5JQF8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1L2AQ5JQF8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PABPC1L2AQ5JQF8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PABPC1L2AQ5JQF8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1L2AQ5JQF8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1L2AQ5JQF8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PABPC1L2AQ5JQF8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PABPC1L2AQ5JQF8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PABPC1L2AQ5JQF8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC1L2AQ5JQF8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC1L2AQ5JQF8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PABPC1L2AQ5JQF8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PABPC1L2AQ5JQF8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms