Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C3orf38Q5JPI3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C3orf38Q5JPI3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C3orf38Q5JPI3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C3orf38Q5JPI3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C3orf38Q5JPI3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C3orf38Q5JPI3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C3orf38Q5JPI3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C3orf38Q5JPI3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C3orf38Q5JPI3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C3orf38Q5JPI3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C3orf38Q5JPI3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C3orf38Q5JPI3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C3orf38Q5JPI3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C3orf38Q5JPI3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C3orf38Q5JPI3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C3orf38Q5JPI3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C3orf38Q5JPI3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C3orf38Q5JPI3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C3orf38Q5JPI3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C3orf38Q5JPI3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C3orf38Q5JPI3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C3orf38Q5JPI3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms