Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rtl5Q5DTT4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rtl5Q5DTT4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rtl5Q5DTT4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Rtl5Q5DTT4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rtl5Q5DTT4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Rtl5Q5DTT4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Rtl5Q5DTT4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Rtl5Q5DTT4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Rtl5Q5DTT4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rtl5Q5DTT4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rtl5Q5DTT4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rtl5Q5DTT4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Rtl5Q5DTT4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rtl5Q5DTT4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rtl5Q5DTT4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rtl5Q5DTT4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Rtl5Q5DTT4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rtl5Q5DTT4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rtl5Q5DTT4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Rtl5Q5DTT4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rtl5Q5DTT4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Rtl5Q5DTT4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rtl5Q5DTT4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rtl5Q5DTT4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rtl5Q5DTT4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Rtl5Q5DTT4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rtl5Q5DTT4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rtl5Q5DTT4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rtl5Q5DTT4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rtl5Q5DTT4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rtl5Q5DTT4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rtl5Q5DTT4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rtl5Q5DTT4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rtl5Q5DTT4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rtl5Q5DTT4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Rtl5Q5DTT4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rtl5Q5DTT4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rtl5Q5DTT4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rtl5Q5DTT4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rtl5Q5DTT4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rtl5Q5DTT4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
Rtl5Q5DTT4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Rtl5Q5DTT4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rtl5Q5DTT4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rtl5Q5DTT4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rtl5Q5DTT4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rtl5Q5DTT4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rtl5Q5DTT4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rtl5Q5DTT4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rtl5Q5DTT4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rtl5Q5DTT4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rtl5Q5DTT4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rtl5Q5DTT4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rtl5Q5DTT4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rtl5Q5DTT4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rtl5Q5DTT4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rtl5Q5DTT4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rtl5Q5DTT4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rtl5Q5DTT4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rtl5Q5DTT4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rtl5Q5DTT4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rtl5Q5DTT4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rtl5Q5DTT4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rtl5Q5DTT4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rtl5Q5DTT4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rtl5Q5DTT4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rtl5Q5DTT4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rtl5Q5DTT4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rtl5Q5DTT4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rtl5Q5DTT4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rtl5Q5DTT4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rtl5Q5DTT4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rtl5Q5DTT4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rtl5Q5DTT4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rtl5Q5DTT4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl5Q5DTT4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl5Q5DTT4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rtl5Q5DTT4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rtl5Q5DTT4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rtl5Q5DTT4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rtl5Q5DTT4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rtl5Q5DTT4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rtl5Q5DTT4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rtl5Q5DTT4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Rtl5Q5DTT4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rtl5Q5DTT4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rtl5Q5DTT4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rtl5Q5DTT4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rtl5Q5DTT4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Rtl5Q5DTT4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms