Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJH7

YIF1B, Protein YIF1B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIF1BQ5BJH7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YIF1BQ5BJH7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YIF1BQ5BJH7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YIF1BQ5BJH7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YIF1BQ5BJH7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIF1BQ5BJH7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIF1BQ5BJH7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIF1BQ5BJH7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIF1BQ5BJH7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIF1BQ5BJH7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIF1BQ5BJH7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIF1BQ5BJH7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIF1BQ5BJH7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
YIF1BQ5BJH7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIF1BQ5BJH7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIF1BQ5BJH7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIF1BQ5BJH7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIF1BQ5BJH7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms