Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KHDC3LQ587J8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KHDC3LQ587J8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KHDC3LQ587J8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KHDC3LQ587J8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KHDC3LQ587J8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KHDC3LQ587J8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KHDC3LQ587J8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KHDC3LQ587J8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms