Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESCO2Q56NI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESCO2Q56NI9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESCO2Q56NI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESCO2Q56NI9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESCO2Q56NI9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ESCO2Q56NI9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ESCO2Q56NI9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ESCO2Q56NI9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ESCO2Q56NI9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESCO2Q56NI9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESCO2Q56NI9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESCO2Q56NI9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ESCO2Q56NI9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ESCO2Q56NI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESCO2Q56NI9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESCO2Q56NI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESCO2Q56NI9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESCO2Q56NI9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESCO2Q56NI9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESCO2Q56NI9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESCO2Q56NI9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms