Protein–RNA interactions for Protein: Q53H80

AKIRIN2, Akirin-2, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIRIN2Q53H80 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AKIRIN2Q53H80 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKIRIN2Q53H80 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AKIRIN2Q53H80 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AKIRIN2Q53H80 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKIRIN2Q53H80 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AKIRIN2Q53H80 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKIRIN2Q53H80 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKIRIN2Q53H80 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKIRIN2Q53H80 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AKIRIN2Q53H80 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AKIRIN2Q53H80 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AKIRIN2Q53H80 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AKIRIN2Q53H80 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AKIRIN2Q53H80 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AKIRIN2Q53H80 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AKIRIN2Q53H80 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AKIRIN2Q53H80 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AKIRIN2Q53H80 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AKIRIN2Q53H80 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms