Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL12Q53G59 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL12Q53G59 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL12Q53G59 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL12Q53G59 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL12Q53G59 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL12Q53G59 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL12Q53G59 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL12Q53G59 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms