Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPAT3Q53EU6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAT3Q53EU6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAT3Q53EU6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPAT3Q53EU6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPAT3Q53EU6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPAT3Q53EU6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPAT3Q53EU6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPAT3Q53EU6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPAT3Q53EU6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPAT3Q53EU6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPAT3Q53EU6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GPAT3Q53EU6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAT3Q53EU6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPAT3Q53EU6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GPAT3Q53EU6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPAT3Q53EU6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPAT3Q53EU6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPAT3Q53EU6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPAT3Q53EU6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPAT3Q53EU6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPAT3Q53EU6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPAT3Q53EU6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPAT3Q53EU6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms