Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNDC3BQ53EP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FNDC3BQ53EP0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC3BQ53EP0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC3BQ53EP0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FNDC3BQ53EP0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FNDC3BQ53EP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FNDC3BQ53EP0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FNDC3BQ53EP0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FNDC3BQ53EP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FNDC3BQ53EP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FNDC3BQ53EP0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FNDC3BQ53EP0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms