Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARHGAP29Q52LW3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGAP29Q52LW3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGAP29Q52LW3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGAP29Q52LW3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARHGAP29Q52LW3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP29Q52LW3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP29Q52LW3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ARHGAP29Q52LW3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ARHGAP29Q52LW3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARHGAP29Q52LW3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARHGAP29Q52LW3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ARHGAP29Q52LW3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP29Q52LW3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ARHGAP29Q52LW3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ARHGAP29Q52LW3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ARHGAP29Q52LW3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGAP29Q52LW3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGAP29Q52LW3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms