Protein–RNA interactions for Protein: Q4W5N1

ABCA11P, Putative ATP-binding cassette sub-family A member 11, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA11PQ4W5N1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA11PQ4W5N1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA11PQ4W5N1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCA11PQ4W5N1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCA11PQ4W5N1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCA11PQ4W5N1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA11PQ4W5N1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCA11PQ4W5N1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA11PQ4W5N1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms