Protein–RNA interactions for Protein: Q4ADV7

RIC1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC1Q4ADV7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RIC1Q4ADV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RIC1Q4ADV7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RIC1Q4ADV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RIC1Q4ADV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RIC1Q4ADV7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RIC1Q4ADV7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RIC1Q4ADV7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RIC1Q4ADV7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RIC1Q4ADV7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RIC1Q4ADV7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RIC1Q4ADV7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RIC1Q4ADV7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIC1Q4ADV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIC1Q4ADV7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIC1Q4ADV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIC1Q4ADV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIC1Q4ADV7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIC1Q4ADV7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RIC1Q4ADV7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RIC1Q4ADV7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIC1Q4ADV7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RIC1Q4ADV7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RIC1Q4ADV7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RIC1Q4ADV7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
RIC1Q4ADV7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RIC1Q4ADV7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RIC1Q4ADV7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms