Protein–RNA interactions for Protein: Q3V172

Sel1l2, Protein sel-1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l2Q3V172 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sel1l2Q3V172 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sel1l2Q3V172 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sel1l2Q3V172 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sel1l2Q3V172 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sel1l2Q3V172 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sel1l2Q3V172 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sel1l2Q3V172 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sel1l2Q3V172 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sel1l2Q3V172 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sel1l2Q3V172 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sel1l2Q3V172 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sel1l2Q3V172 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sel1l2Q3V172 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sel1l2Q3V172 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sel1l2Q3V172 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sel1l2Q3V172 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sel1l2Q3V172 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sel1l2Q3V172 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sel1l2Q3V172 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sel1l2Q3V172 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sel1l2Q3V172 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sel1l2Q3V172 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sel1l2Q3V172 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sel1l2Q3V172 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms