Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C3

Nutm2, NUT family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nutm2Q3V0C3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nutm2Q3V0C3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nutm2Q3V0C3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nutm2Q3V0C3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nutm2Q3V0C3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nutm2Q3V0C3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nutm2Q3V0C3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nutm2Q3V0C3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nutm2Q3V0C3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nutm2Q3V0C3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nutm2Q3V0C3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nutm2Q3V0C3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nutm2Q3V0C3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nutm2Q3V0C3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nutm2Q3V0C3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nutm2Q3V0C3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nutm2Q3V0C3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nutm2Q3V0C3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nutm2Q3V0C3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nutm2Q3V0C3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nutm2Q3V0C3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms