Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nr1d1Q3UV55 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nr1d1Q3UV55 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nr1d1Q3UV55 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nr1d1Q3UV55 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nr1d1Q3UV55 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nr1d1Q3UV55 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nr1d1Q3UV55 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nr1d1Q3UV55 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nr1d1Q3UV55 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nr1d1Q3UV55 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nr1d1Q3UV55 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nr1d1Q3UV55 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nr1d1Q3UV55 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nr1d1Q3UV55 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nr1d1Q3UV55 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1d1Q3UV55 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr1d1Q3UV55 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms