Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdkl5Q3UTQ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdkl5Q3UTQ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdkl5Q3UTQ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdkl5Q3UTQ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdkl5Q3UTQ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdkl5Q3UTQ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdkl5Q3UTQ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdkl5Q3UTQ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdkl5Q3UTQ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdkl5Q3UTQ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdkl5Q3UTQ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdkl5Q3UTQ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdkl5Q3UTQ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdkl5Q3UTQ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdkl5Q3UTQ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdkl5Q3UTQ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdkl5Q3UTQ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdkl5Q3UTQ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdkl5Q3UTQ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdkl5Q3UTQ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdkl5Q3UTQ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdkl5Q3UTQ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdkl5Q3UTQ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdkl5Q3UTQ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdkl5Q3UTQ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdkl5Q3UTQ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdkl5Q3UTQ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdkl5Q3UTQ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdkl5Q3UTQ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdkl5Q3UTQ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdkl5Q3UTQ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdkl5Q3UTQ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdkl5Q3UTQ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdkl5Q3UTQ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdkl5Q3UTQ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.7 ms