Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cep63Q3UPP8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cep63Q3UPP8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cep63Q3UPP8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cep63Q3UPP8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cep63Q3UPP8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cep63Q3UPP8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep63Q3UPP8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep63Q3UPP8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cep63Q3UPP8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep63Q3UPP8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cep63Q3UPP8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep63Q3UPP8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cep63Q3UPP8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep63Q3UPP8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cep63Q3UPP8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cep63Q3UPP8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cep63Q3UPP8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep63Q3UPP8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cep63Q3UPP8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep63Q3UPP8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep63Q3UPP8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cep63Q3UPP8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep63Q3UPP8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cep63Q3UPP8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cep63Q3UPP8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cep63Q3UPP8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cep63Q3UPP8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cep63Q3UPP8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep63Q3UPP8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cep63Q3UPP8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cep63Q3UPP8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep63Q3UPP8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cep63Q3UPP8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cep63Q3UPP8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cep63Q3UPP8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cep63Q3UPP8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cep63Q3UPP8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cep63Q3UPP8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep63Q3UPP8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cep63Q3UPP8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep63Q3UPP8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cep63Q3UPP8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms