Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Skap2Q3UND0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Skap2Q3UND0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Skap2Q3UND0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Skap2Q3UND0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skap2Q3UND0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Skap2Q3UND0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skap2Q3UND0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Skap2Q3UND0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Skap2Q3UND0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skap2Q3UND0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skap2Q3UND0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skap2Q3UND0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skap2Q3UND0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skap2Q3UND0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap2Q3UND0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skap2Q3UND0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skap2Q3UND0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms