Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft2Q3UF64 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnft2Q3UF64 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnft2Q3UF64 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnft2Q3UF64 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnft2Q3UF64 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnft2Q3UF64 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnft2Q3UF64 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnft2Q3UF64 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms