Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYE7

Tmem136, Transmembrane protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem136Q3TYE7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem136Q3TYE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem136Q3TYE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem136Q3TYE7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem136Q3TYE7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem136Q3TYE7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem136Q3TYE7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem136Q3TYE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem136Q3TYE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem136Q3TYE7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem136Q3TYE7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem136Q3TYE7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms