Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
InipQ3TXT3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
InipQ3TXT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
InipQ3TXT3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
InipQ3TXT3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
InipQ3TXT3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
InipQ3TXT3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
InipQ3TXT3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InipQ3TXT3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
InipQ3TXT3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
InipQ3TXT3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
InipQ3TXT3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
InipQ3TXT3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
InipQ3TXT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms