Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trappc10Q3TLI0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trappc10Q3TLI0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trappc10Q3TLI0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trappc10Q3TLI0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trappc10Q3TLI0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trappc10Q3TLI0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trappc10Q3TLI0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trappc10Q3TLI0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Trappc10Q3TLI0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc10Q3TLI0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trappc10Q3TLI0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trappc10Q3TLI0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trappc10Q3TLI0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trappc10Q3TLI0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc10Q3TLI0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc10Q3TLI0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trappc10Q3TLI0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trappc10Q3TLI0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trappc10Q3TLI0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trappc10Q3TLI0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trappc10Q3TLI0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trappc10Q3TLI0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trappc10Q3TLI0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trappc10Q3TLI0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Trappc10Q3TLI0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc10Q3TLI0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trappc10Q3TLI0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trappc10Q3TLI0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trappc10Q3TLI0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trappc10Q3TLI0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc10Q3TLI0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc10Q3TLI0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trappc10Q3TLI0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trappc10Q3TLI0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms