Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP13-3Q3SY46 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP13-3Q3SY46 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP13-3Q3SY46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP13-3Q3SY46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms