Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXR2

C3orf36, Uncharacterized protein C3orf36, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf36Q3SXR2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf36Q3SXR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf36Q3SXR2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf36Q3SXR2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf36Q3SXR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf36Q3SXR2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf36Q3SXR2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf36Q3SXR2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf36Q3SXR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf36Q3SXR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf36Q3SXR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf36Q3SXR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C3orf36Q3SXR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C3orf36Q3SXR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf36Q3SXR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms