Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM30BQ3MIR4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30BQ3MIR4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30BQ3MIR4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM30BQ3MIR4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM30BQ3MIR4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30BQ3MIR4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30BQ3MIR4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30BQ3MIR4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM30BQ3MIR4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30BQ3MIR4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms