Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd163Q2VLH6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd163Q2VLH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd163Q2VLH6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd163Q2VLH6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd163Q2VLH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd163Q2VLH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd163Q2VLH6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd163Q2VLH6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cd163Q2VLH6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cd163Q2VLH6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd163Q2VLH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cd163Q2VLH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cd163Q2VLH6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd163Q2VLH6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd163Q2VLH6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cd163Q2VLH6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cd163Q2VLH6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cd163Q2VLH6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cd163Q2VLH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cd163Q2VLH6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cd163Q2VLH6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cd163Q2VLH6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd163Q2VLH6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd163Q2VLH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd163Q2VLH6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cd163Q2VLH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd163Q2VLH6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd163Q2VLH6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd163Q2VLH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd163Q2VLH6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cd163Q2VLH6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd163Q2VLH6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cd163Q2VLH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cd163Q2VLH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cd163Q2VLH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cd163Q2VLH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms