Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX9

C2orf68, UPF0561 protein C2orf68, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf68Q2NKX9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C2orf68Q2NKX9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C2orf68Q2NKX9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C2orf68Q2NKX9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf68Q2NKX9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2orf68Q2NKX9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C2orf68Q2NKX9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C2orf68Q2NKX9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C2orf68Q2NKX9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms