Protein–RNA interactions for Protein: Q2M389

WASHC4, WASH complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC4Q2M389 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
WASHC4Q2M389 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
WASHC4Q2M389 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC4Q2M389 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
WASHC4Q2M389 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
WASHC4Q2M389 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
WASHC4Q2M389 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
WASHC4Q2M389 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
WASHC4Q2M389 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
WASHC4Q2M389 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
WASHC4Q2M389 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
WASHC4Q2M389 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
WASHC4Q2M389 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
WASHC4Q2M389 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC4Q2M389 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC4Q2M389 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
WASHC4Q2M389 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
WASHC4Q2M389 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
WASHC4Q2M389 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
WASHC4Q2M389 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
WASHC4Q2M389 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
WASHC4Q2M389 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC4Q2M389 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC4Q2M389 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC4Q2M389 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC4Q2M389 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC4Q2M389 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
WASHC4Q2M389 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
WASHC4Q2M389 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
WASHC4Q2M389 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
WASHC4Q2M389 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
WASHC4Q2M389 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
WASHC4Q2M389 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
WASHC4Q2M389 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
WASHC4Q2M389 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
WASHC4Q2M389 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
WASHC4Q2M389 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
WASHC4Q2M389 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
WASHC4Q2M389 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
WASHC4Q2M389 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms