Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GEN1Q17RS7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GEN1Q17RS7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GEN1Q17RS7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GEN1Q17RS7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GEN1Q17RS7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GEN1Q17RS7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GEN1Q17RS7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GEN1Q17RS7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GEN1Q17RS7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GEN1Q17RS7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GEN1Q17RS7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms