Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIGD6Q17RP2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIGD6Q17RP2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TIGD6Q17RP2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIGD6Q17RP2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TIGD6Q17RP2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD6Q17RP2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD6Q17RP2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIGD6Q17RP2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms