Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC142Q17RM4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC142Q17RM4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC142Q17RM4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC142Q17RM4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC142Q17RM4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC142Q17RM4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC142Q17RM4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC142Q17RM4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC142Q17RM4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
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