Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCL15Q16663 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCL15Q16663 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCL15Q16663 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CCL15Q16663 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCL15Q16663 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCL15Q16663 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CCL15Q16663 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCL15Q16663 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCL15Q16663 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCL15Q16663 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CCL15Q16663 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCL15Q16663 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCL15Q16663 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CCL15Q16663 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CCL15Q16663 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCL15Q16663 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCL15Q16663 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCL15Q16663 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCL15Q16663 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCL15Q16663 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCL15Q16663 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCL15Q16663 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
CCL15Q16663 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCL15Q16663 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCL15Q16663 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CCL15Q16663 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCL15Q16663 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCL15Q16663 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCL15Q16663 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCL15Q16663 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCL15Q16663 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCL15Q16663 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCL15Q16663 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCL15Q16663 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCL15Q16663 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCL15Q16663 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCL15Q16663 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CCL15Q16663 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCL15Q16663 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms