Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF9Q16594 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TAF9Q16594 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF9Q16594 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF9Q16594 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF9Q16594 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF9Q16594 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF9Q16594 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF9Q16594 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF9Q16594 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TAF9Q16594 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF9Q16594 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF9Q16594 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF9Q16594 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms