Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRPL23Q16540 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL23Q16540 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL23Q16540 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MRPL23Q16540 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MRPL23Q16540 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MRPL23Q16540 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms