Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSX2Q16385 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSX2Q16385 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSX2Q16385 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX2Q16385 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX2Q16385 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX2Q16385 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX2Q16385 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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