Protein–RNA interactions for Protein: Q15800

MSMO1, Methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1Q15800 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSMO1Q15800 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSMO1Q15800 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSMO1Q15800 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSMO1Q15800 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSMO1Q15800 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MSMO1Q15800 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSMO1Q15800 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSMO1Q15800 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MSMO1Q15800 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSMO1Q15800 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSMO1Q15800 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSMO1Q15800 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSMO1Q15800 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSMO1Q15800 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSMO1Q15800 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSMO1Q15800 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSMO1Q15800 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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