Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFNB3Q15768 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFNB3Q15768 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNB3Q15768 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNB3Q15768 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFNB3Q15768 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFNB3Q15768 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EFNB3Q15768 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms