Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF1Q15637 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF1Q15637 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF1Q15637 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF1Q15637 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF1Q15637 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF1Q15637 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF1Q15637 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF1Q15637 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF1Q15637 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF1Q15637 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF1Q15637 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF1Q15637 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF1Q15637 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF1Q15637 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF1Q15637 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SF1Q15637 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF1Q15637 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF1Q15637 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF1Q15637 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SF1Q15637 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF1Q15637 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SF1Q15637 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SF1Q15637 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF1Q15637 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SF1Q15637 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF1Q15637 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SF1Q15637 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SF1Q15637 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SF1Q15637 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SF1Q15637 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SF1Q15637 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SF1Q15637 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF1Q15637 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF1Q15637 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SF1Q15637 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SF1Q15637 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF1Q15637 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SF1Q15637 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF1Q15637 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF1Q15637 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF1Q15637 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SF1Q15637 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF1Q15637 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF1Q15637 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF1Q15637 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF1Q15637 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SF1Q15637 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF1Q15637 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF1Q15637 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF1Q15637 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF1Q15637 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF1Q15637 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF1Q15637 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF1Q15637 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF1Q15637 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF1Q15637 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF1Q15637 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF1Q15637 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF1Q15637 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF1Q15637 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF1Q15637 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF1Q15637 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SF1Q15637 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SF1Q15637 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SF1Q15637 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF1Q15637 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF1Q15637 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF1Q15637 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF1Q15637 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF1Q15637 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF1Q15637 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF1Q15637 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF1Q15637 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF1Q15637 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF1Q15637 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF1Q15637 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF1Q15637 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF1Q15637 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF1Q15637 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SF1Q15637 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF1Q15637 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SF1Q15637 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SF1Q15637 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF1Q15637 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF1Q15637 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SF1Q15637 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF1Q15637 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SF1Q15637 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SF1Q15637 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF1Q15637 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF1Q15637 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SF1Q15637 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF1Q15637 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SF1Q15637 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF1Q15637 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF1Q15637 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF1Q15637 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SF1Q15637 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF1Q15637 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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