Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAM1Q15629 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAM1Q15629 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAM1Q15629 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAM1Q15629 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAM1Q15629 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAM1Q15629 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAM1Q15629 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAM1Q15629 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAM1Q15629 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAM1Q15629 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAM1Q15629 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAM1Q15629 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAM1Q15629 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAM1Q15629 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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