Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CYTH1Q15438 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYTH1Q15438 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYTH1Q15438 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH1Q15438 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH1Q15438 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH1Q15438 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH1Q15438 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYTH1Q15438 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH1Q15438 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CYTH1Q15438 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CYTH1Q15438 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CYTH1Q15438 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYTH1Q15438 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYTH1Q15438 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CYTH1Q15438 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYTH1Q15438 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYTH1Q15438 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYTH1Q15438 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH1Q15438 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH1Q15438 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH1Q15438 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYTH1Q15438 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYTH1Q15438 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYTH1Q15438 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYTH1Q15438 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYTH1Q15438 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYTH1Q15438 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms