Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BECN1Q14457 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BECN1Q14457 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BECN1Q14457 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BECN1Q14457 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BECN1Q14457 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BECN1Q14457 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
BECN1Q14457 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
BECN1Q14457 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
BECN1Q14457 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BECN1Q14457 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BECN1Q14457 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BECN1Q14457 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
BECN1Q14457 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BECN1Q14457 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BECN1Q14457 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BECN1Q14457 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BECN1Q14457 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BECN1Q14457 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BECN1Q14457 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BECN1Q14457 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BECN1Q14457 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BECN1Q14457 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BECN1Q14457 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BECN1Q14457 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
BECN1Q14457 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BECN1Q14457 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
BECN1Q14457 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
BECN1Q14457 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
BECN1Q14457 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
BECN1Q14457 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
BECN1Q14457 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BECN1Q14457 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BECN1Q14457 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BECN1Q14457 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BECN1Q14457 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
BECN1Q14457 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BECN1Q14457 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BECN1Q14457 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BECN1Q14457 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
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