Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAB33AQ14088 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB33AQ14088 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB33AQ14088 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB33AQ14088 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB33AQ14088 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB33AQ14088 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB33AQ14088 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB33AQ14088 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB33AQ14088 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB33AQ14088 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RAB33AQ14088 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB33AQ14088 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB33AQ14088 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAB33AQ14088 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB33AQ14088 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAB33AQ14088 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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RAB33AQ14088 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB33AQ14088 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
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RAB33AQ14088 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAB33AQ14088 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAB33AQ14088 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB33AQ14088 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB33AQ14088 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB33AQ14088 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB33AQ14088 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB33AQ14088 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
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