Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALCAMQ13740 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ALCAMQ13740 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ALCAMQ13740 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ALCAMQ13740 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALCAMQ13740 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ALCAMQ13740 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALCAMQ13740 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ALCAMQ13740 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ALCAMQ13740 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALCAMQ13740 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALCAMQ13740 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ALCAMQ13740 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALCAMQ13740 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALCAMQ13740 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
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