Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CUL4AQ13619 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CUL4AQ13619 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CUL4AQ13619 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CUL4AQ13619 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CUL4AQ13619 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CUL4AQ13619 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CUL4AQ13619 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CUL4AQ13619 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CUL4AQ13619 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CUL4AQ13619 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CUL4AQ13619 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CUL4AQ13619 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CUL4AQ13619 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CUL4AQ13619 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CUL4AQ13619 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
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