Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAMK2DQ13557 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMK2DQ13557 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMK2DQ13557 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAMK2DQ13557 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAMK2DQ13557 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMK2DQ13557 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMK2DQ13557 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMK2DQ13557 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAMK2DQ13557 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMK2DQ13557 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAMK2DQ13557 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMK2DQ13557 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAMK2DQ13557 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMK2DQ13557 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAMK2DQ13557 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMK2DQ13557 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAMK2DQ13557 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAMK2DQ13557 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAMK2DQ13557 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAMK2DQ13557 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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