Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSAMPQ13449 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSAMPQ13449 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSAMPQ13449 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSAMPQ13449 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LSAMPQ13449 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSAMPQ13449 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LSAMPQ13449 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LSAMPQ13449 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSAMPQ13449 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSAMPQ13449 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LSAMPQ13449 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LSAMPQ13449 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSAMPQ13449 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSAMPQ13449 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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