Protein–RNA interactions for Protein: Q13418

ILK, Integrin-linked protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKQ13418 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ILKQ13418 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ILKQ13418 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ILKQ13418 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ILKQ13418 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ILKQ13418 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ILKQ13418 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ILKQ13418 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ILKQ13418 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ILKQ13418 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ILKQ13418 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ILKQ13418 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ILKQ13418 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ILKQ13418 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ILKQ13418 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ILKQ13418 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ILKQ13418 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ILKQ13418 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ILKQ13418 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ILKQ13418 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ILKQ13418 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ILKQ13418 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ILKQ13418 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ILKQ13418 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ILKQ13418 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ILKQ13418 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ILKQ13418 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ILKQ13418 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ILKQ13418 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ILKQ13418 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ILKQ13418 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ILKQ13418 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ILKQ13418 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ILKQ13418 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ILKQ13418 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ILKQ13418 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ILKQ13418 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ILKQ13418 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ILKQ13418 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ILKQ13418 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ILKQ13418 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ILKQ13418 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ILKQ13418 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ILKQ13418 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ILKQ13418 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ILKQ13418 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ILKQ13418 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ILKQ13418 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ILKQ13418 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ILKQ13418 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ILKQ13418 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ILKQ13418 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ILKQ13418 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ILKQ13418 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ILKQ13418 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ILKQ13418 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ILKQ13418 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ILKQ13418 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ILKQ13418 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ILKQ13418 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ILKQ13418 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ILKQ13418 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ILKQ13418 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ILKQ13418 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ILKQ13418 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ILKQ13418 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ILKQ13418 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ILKQ13418 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ILKQ13418 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ILKQ13418 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ILKQ13418 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ILKQ13418 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ILKQ13418 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ILKQ13418 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ILKQ13418 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ILKQ13418 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ILKQ13418 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ILKQ13418 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ILKQ13418 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ILKQ13418 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ILKQ13418 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ILKQ13418 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ILKQ13418 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ILKQ13418 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ILKQ13418 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ILKQ13418 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ILKQ13418 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ILKQ13418 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ILKQ13418 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ILKQ13418 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ILKQ13418 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ILKQ13418 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ILKQ13418 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ILKQ13418 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ILKQ13418 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ILKQ13418 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ILKQ13418 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ILKQ13418 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ILKQ13418 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ILKQ13418 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms