Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATMQ13315 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMQ13315 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATMQ13315 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATMQ13315 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATMQ13315 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATMQ13315 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATMQ13315 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATMQ13315 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATMQ13315 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATMQ13315 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATMQ13315 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATMQ13315 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATMQ13315 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATMQ13315 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATMQ13315 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATMQ13315 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATMQ13315 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATMQ13315 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATMQ13315 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATMQ13315 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATMQ13315 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATMQ13315 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATMQ13315 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATMQ13315 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATMQ13315 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATMQ13315 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMQ13315 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATMQ13315 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMQ13315 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMQ13315 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATMQ13315 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATMQ13315 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATMQ13315 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATMQ13315 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATMQ13315 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATMQ13315 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMQ13315 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMQ13315 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMQ13315 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATMQ13315 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMQ13315 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATMQ13315 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMQ13315 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATMQ13315 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATMQ13315 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMQ13315 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMQ13315 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMQ13315 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMQ13315 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMQ13315 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATMQ13315 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATMQ13315 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATMQ13315 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATMQ13315 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATMQ13315 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMQ13315 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMQ13315 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATMQ13315 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATMQ13315 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATMQ13315 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATMQ13315 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMQ13315 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMQ13315 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMQ13315 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMQ13315 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATMQ13315 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATMQ13315 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMQ13315 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATMQ13315 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATMQ13315 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMQ13315 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMQ13315 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATMQ13315 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATMQ13315 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMQ13315 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMQ13315 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATMQ13315 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMQ13315 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMQ13315 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATMQ13315 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATMQ13315 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATMQ13315 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATMQ13315 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATMQ13315 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATMQ13315 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATMQ13315 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATMQ13315 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATMQ13315 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATMQ13315 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATMQ13315 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATMQ13315 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATMQ13315 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATMQ13315 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATMQ13315 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATMQ13315 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATMQ13315 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATMQ13315 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATMQ13315 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATMQ13315 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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