Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERCC8Q13216 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERCC8Q13216 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERCC8Q13216 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERCC8Q13216 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERCC8Q13216 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERCC8Q13216 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERCC8Q13216 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC8Q13216 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERCC8Q13216 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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